2017 m. Užusalių mokykla šventė 150-ąsias metines.

Pirmoji mokykla Užusaliuose įsteigta 1867 m. Nuo 1887 m. mokyklą savo žinion perėmė liaudies švietimo ministerija. Tuomet ji buvo vadinama liaudies švietimo ministerijos dviejų klasių mokykla.

1909 m. pastatytas naujas mokyklos pastatas, kuriame įsikūrė keturių klasių pradinė mokykla.

1945–1948 m. veikė Užusalių pradinė mokykla, Užusalių progimnazija.

1949–1961 m. buvo septynmetė, 1962–1967 m. – aštuonmetė mokykla.

Keletą metų, 1967–1970 m., veikė Užusalių vidurinė mokykla. Nuo 1970 m. – Užusalių aštuonmetė mokykla, 1986 m. - Užusalių nepilna vidurinė mokykla, 1988-1993 m. – Užusalių devynmetė mokykla.

Nuo 1993 m. – pagrindinė mokykla.

2019 m. rugsėjo 1 d. Užusalių pagrindinė mokykla reorganizuota į mokyklą-daugiafunkcį centrą (pakeista mokyklos paskirtis).

Nuo 2023 m. rugsėjo 1 d. – reorganizuota prijungiant prie Jonavos rajono Šveicarijos progimnazijos. Pilnas pavadinimas Jonavos rajono Šveicarijos progimnazijos Užusalių skyrius. Vykdo ikimokyklinio, priešmokyklinio, pradinio ugdymo programas, individualizuotą pradinio ugdymo ir neformaliojo vaikų švietimo programas.

Šiuo metu Užusalių skyriuje dirba 27 darbuotojai (iš jų 14 pedagoginiai darbuotojai), mokosi 79 mokiniai (iš jų 39 PUG, 1-4 klasėse).